Để góp phần xây dựng y tế công cộng ngày càng phát triển và góp phần tích cực vào sự nghiệp chăm sóc và bảo vệ sức khoẻ nhân dân trong thời kỳ mới; ngày ?? tháng ?? năm 2002 Thủ tướng chính phủ đã ra quyết định số ? thành lập Hôi y tế công cộng Việt Nam. Thành viên ban chấp hành của Hội y tế công cộng Việt Nam là nhũng chuyên gia hàng đầu trong lĩnh vực y tế công cộng cũng như các chuyên ngành khác của Việt Nam.
Với sự đóng góp về địa điểm và nhân lực của trường Đại học Y tế công cộng (YTCC) và sự tài trợ kinh phí của tổ chức Atlantic Philanthropies, Mỹ, tứ tháng 1/2004, Văn phòng trung ương Hội đã được thành lập.
Ngay sau khi thành lập, các thành viên của ban chấp hành và các cán bộ văn phòng Hội y tế công cộng Việt Nam đã làm việc tích cực để xây dựng các quy trình làm việc giúp cho các hoạt động của Hội được duy trì lâu dài, có tổ chức và theo các chuẩn mực và quy tắc nhất định.
Trong qúa trình xây dựng quy trình, với sự tài trợ của Tổ chức y tế thế giới, Trung ương Hội đã mời một chuyên gia cao cấp của Hội y tế công cộng Newzeland, ông Jonh Smith, giúp trung ương Hội xây dựng kế hoạch hoạt động cho năm 2004, và đề xuất các định hướng phát triển các hoạt động lâu dài của Hội.
Đặc biệt, từ tháng 2/2004, Hội cũng hợp tác với Tổ chức HealthBridge Canada ( trước đây là tổ chức Path Canada) để kếp nạp Nhóm hoạt động phòng chống thuốc lá (NHDPCTL) là một thành viên chính thức của Hội y tế công cộng Việt Nam nhằm đảm bảo tính hợp pháp và sự ổn định lâu dài của nhóm. Từ năm đầu 2004 đến nay, Hội y tế công cộng Việt Nam đã hợp tác với tổ chức HealthBridge Canada tiến hành nhiều can thiệp trong lĩnh vực phòng chống thuốc lá ở cấp độ quốc gia cũng như cấp độ địa phương như: Mainstreaming, Giảm sự chấp nhận của xã hội đối với hành vi hút thuốc tại Việt Nam....
Đặc biệt trong thời gian gần đây Hội cũng đã mở rộng hợp tác với nhiều cơ sở trong mạng lưới y tế trên toàn quốc, các tổ chức quốc tế như Hội y tế công cộng thế giới, liên minh phòng chống thuốc lá Đông Nam Á (SEATCA),..... Đặc biệt Hội đang hợp tác với Quỹ Ford và Hội y tế công cộng Đồng Nai để tiến hành nghiên cứu can thiệp " Giảm thiệu nguy cơ nhiễm độc Dioxin cho người dân tại điểm nóng Biên Hoà - Đồng Nai )